Inom jordbruksindustrin som helhet har reptiler inte ett stort kommersiellt värde jämfört med höns och hovdäggdjur.de har dock ett betydande ekonomiskt värde för livsmedel och ekologiska tjänster (t. ex. insektsbekämpning) på lokal nivå, och de värderas nationellt och internationellt för livsmedel, läkemedel, lädervaror och PET-handeln.

Reptiler har sin största ekonomiska inverkan i vissa tempererade och många tropiska områden, även om denna inverkan ofta förbises eftersom deras bidrag är helt lokal. Ett monetärt värde är ofta inte tilldelat något ryggradsdjur som ger skadedjursbekämpning. Ändå kontrollerar många ödlor insektsskadegörare i hem och trädgårdar.ormar är stora rovdjur av gnagare, och vikten av gnagarekontroll har visat sig upprepade gånger när populationer av gnagare-ätande ormar decimeras av ormskörd för läderhandeln. Frånvaron av sådana ormar gör det möjligt för gnagare att explodera.

På samma sätt skördas sköldpaddor, krokodiler, ormar och ödlor regelbundet som mat för lokal konsumtion i många tropiska områden. När skörden blir kommersiell överskrider kraven på lokala reptilpopulationer vanligen arternas förmåga att ersätta sig med normala reproduktiva medel. Skörden koncentreras ofta på större individer av de flesta arter, och dessa individer är ofta vuxna honor och män i befolkningen; deras avlägsnande minskar avsevärt avelsbeståndet och leder till en kraftig befolkningsminskning.

Överskuggning av krokodiler för läderindustrin på 1950-och 1960-talet orsakade den utbredda utrotningen, eller lokaliserad utrotning, av många krokodilarter. Dessutom upplevde överlevande populationer en nästan världsomspännande minskning av antalet. Sedan dess har bestämmelserna på nationell och internationell nivå kraftigt minskat skördarna, och proaktiva bevarande-och förvaltningsåtgärder har gjort det möjligt för många krokodilpopulationer att återhämta sig. Reglerad skörd ger för närvarande ett tillräckligt antal skinn till läderhandeln och gör det också möjligt för krokodiler att återuppta sin roll som topp rovdjur i många akvatiska ekosystem. Den amerikanska alligatorns (Alligator mississippiensis) återkomst från nära utrotning i sydöstra USA visar att framgångsrik hantering av reptilpopulationer är möjlig om den övervakas noggrant.